[论著]孕妇外周血超短片段游离DNA提取方法的优化 [中文引用][英文引用]

目的 超短片段游离DNA是一种新发现的cfDNA，具备疾病筛查分子标志物潜能。本项目拟通过优化孕妇外周血cfDNA提取方法，实现从孕妇外周血中高效分离和回收uscfDNA。方法 回顾性收集2021年11月至2024年8月于深圳市龙岗区妇幼保健院接受无创产前筛查（noninvasive prenatal screening, NIPS）孕周为12～37周检测的135例孕妇自愿者检测后剩余标本和临床资料。通过使用高比例磁珠和高比例醇类对常规提取方法和回收方式进行优化以提升cfDNA提取效果，将磁珠法与有机试剂抽提和醇沉法相结合来提高纯化效果。结果 通过对常规提取方法的优化，从孕妇外周血中获取到50 bp左右的单链DNA 的uscfDNA，在总cfDNA中占21%~96%。通过评估uscfDNA在基因组中的分布情况，发现其主要在启动子等调节区域富集。结论 本研究通过优化cfDNA提取纯化方法，实现了uscfDNA的高效提取。该方法或可为基于围产领域uscfDNA研究提供帮助。